1945年8月，日本宣布无条件投降。为了维护和平局面，毛泽东亲赴重庆谈判，与国民党当局签订《双十协定》，遏制了蒋介石的内战阴谋。10月间，长江以南7个新解放区的新四军，按党中央的统一部署，主动撤到江北，朱克靖亦离开苏浙区随军北上，进入山东。
12月，新四军在山东重新整编，军部与山东军区合署办公，朱克靖任新四军联络部长、新四军兼山东军区政治部联络部长，对外称新四军秘书长。
为了推迟内战爆发，争取国民党内的反蒋力量，党派朱克靖到郝鹏举部去做统战工作。郝鹏举原是冯玉祥的副官，1924年在苏联学习军事，与朱克靖是同学，此时担任国民党淮海绥靖公署的行政长官。他不是蒋介石的嫡系，心存二意，在我军强大的政治攻势和军事压力下，接受了朱克靖的劝告，于1946年1月6日发表“退出内战，拥护民主”的通电，宣布起义，并将所部改编为华中民主联军，开进山东解放区休整。
朱克靖在完成策动郝鹏举部起义的任务后，作为人民解放军的代表，受陈毅的委托，被派往华中民主联军担任政治委员。山东军区还派遣康宁、刘述周等一批共产党员到民主联军担任政治工作。他们在朱克靖的领导下，着手改造这支部队。朱克靖亲自给部队讲课，介绍人民军队的性质、任务和三大纪律、八项注意，组织宣传队教士兵们唱革命歌曲，在官兵中产生了很大影响。
1946年6月，蒋介石向解放区大举进攻，全面内战爆发。郝鹏举见风使舵，暗地里和国民党参谋总长陈诚联系。11月，国民党军占领了张家口，气焰更加嚣张，又派重兵分两路进攻山东解放区，大有一口吞掉人民解放军之势。郝鹏举开始秘密策划叛变，准备在新年期间行动。这个阴谋被朱克靖及时发觉，并报告了山东军区司令部。于是，陈毅以新年团拜的名义，把郝鹏举请到山东军区所在地临沂，郑重地劝告他：“只有依靠人民才有出路。”郝鹏举闻言，顿觉心惊肉跳，装出一副可怜相，假惺惺地痛哭流涕，并要求率部配合华东野战军发动莱芜战役。为了继续争取郝鹏举，扩大反蒋统一战线，陈毅经请示党中央，还是给了郝鹏举立功悔罪的机会。
1947年1月，朱克靖和郝鹏举一起离开临沂，返回民主联军驻地。临行前，陈毅与朱克靖促膝长谈，他一方面担心朱克靖深入虎穴，凶多吉少；另一方面又希望他对郝鹏举部“能争取一分钟就要争取一分钟”，以便使我军主力部队运动到莱芜集中。朱克靖深知此行肩负责任的重大，坚定地对陈毅表示：“不入虎穴，焉得虎子？”决心克服任何艰难险阻，完成改造民主联军的任务。
但是，郝鹏举回去后，加快了叛变的步伐。1月22日晚，郝鹏举布下圈套，以研究如何配合莱芜战役问题为由，派人请朱克靖出席“军事会议”。朱克靖虽已预感到有某种异常，但从大局考虑，仍带着几名警卫员毅然赴会。他刚一踏进郝鹏举的院子，就被一群荷枪实弹的匪徒包围，朱克靖及秘书王宜生、总务科长刘永春等人被扣押。
朱克靖被捕后，连夜被郝送往海州（今连云港市），作为他投蒋的见面礼。随后，郝鹏举率部向国民党统治区移动。山东军区广大指挥员闻讯，无不义愤填膺，于2月6日发起讨郝战斗，在苏北白塔埠包围了叛军，全歼该部所辖的2个师，并活捉郝鹏举。
朱克靖被捕后，先后被关押在徐州、苏州，后被敌人移送到南京国民党国防部保密局宁海路19号看守所。国民党为了谎报“战绩”，竟在报纸上制造谣言，编造出朱克靖是在战场上被俘的。为了进一步使朱克靖“登报悔悟”，国民党保密局的几个反动军官，以所谓“同学”、“熟人”的关系前来劝降，均被朱克靖严词拒绝，时过半年，敌人仍一无所获。
朱克靖的妻子肖仲之从国民党的报纸上得知丈夫被关押南京，心急如焚，领着儿子文泉，千里迢迢从湖南赶去探监。无奈墙高院深，无法见到，只得央求醴陵籍的国民党军界人士帮忙。当时，刘斐、李明濒（分别为原国民党国防部次长、重庆卫戍司令，后来均成为起义将领）正闲居南京，他们劝肖仲之母子说：“你们现在去看，真是太危险了，很有可能把你们也一起押起来，作为劝降的人质。”肖仲之只得忍悲含痛携子回乡。从此，他们再也没能与自己的亲人见面。
朱克靖入狱后，国民党军政要员贺衷寒利用同乡、同学、大革命时期的朋友关系，到监狱看望朱克靖，劝他改弦易辙，为国民党工作。朱克靖不为所动，说：“敌人叫我死，叫我回家种地则可，让我骂共产党，为国民党宣传，是痴心妄想！”他还在狱中写诗填词，抒发革命者的情怀。可惜的是，这些战斗诗篇大多失散了，仅保留下来的一首这样写道：
一颗为民心，万古终不泯。
壮士非无泪，不为断头流。
身心为党国，一死何足愁。
字里行间，显示了对党的一片忠诚和不屈不挠的斗争精神。
1947年10月，国民党特务感到黔驴技穷，只得使出卑劣的手段，将朱克靖在南京郊外用绳索秘密勒杀，然后毁尸灭证。牺牲时，朱克靖年仅52岁。
（作者：朱华）
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