1939年3月，李耀珍任三区抗日动委会主任。5月，侵占东平县城的日本侵略军疯狂推行烧光、杀光、抢光政策，大肆残害共产党人和革命群众，制造了骇人听闻的“大羊惨案”。日军杀害无辜村民6人，打伤几十人，抢走财物不计其数，烧毁民房420间，“怀仁堂”药店、“文德昌”百货部、“宏圣源”酱菜铺等工商业户均烧为灰烬。昔日商户林立、生意兴隆的大羊街，变成一片废墟。此时，部分党员干部思想不够坚定，有些群众怨声载道，三区抗日斗争面临严峻的形势，正是在这种紧迫而艰难的情况下，县委任命李耀珍为区委书记，王相臣ƒ任副书记。他们根据县工委的指示，积极发展党员，壮大党的组织，扩大抗日力量。在他的培养教育下，李庆顺、王忠林、李灿华、李灿琪、李灿明等加入中国共产党。三区驻驾村、金山口、龙山屯、辛庄、清水坦、孟村、韩庄、陈庄等22个村建立了党支部。仅驻驾村、金山口两村就发展党员60余人。从1939年到1940年春，三区党组织有较大发展。全区共发展党员300余人。1939年9月，三区建立了全县第一个抗日区公所，李耀珍当选为第一任抗日民主区长，韩省山任民政助理员，张树珂任财经助理员，孟广元任教育督导员。从1938年下半年到1940年下半年期间，三区普遍建立乡、村自卫队。他们站岗放哨，盘查路人，送“鸡毛信”；送公粮，送公柴；破坏公路，拆除桥梁，挖“抗日沟”，阻止敌人扫荡。他还组织游击小组，选党员中年轻又政治坚定的骨干分子，进行反奸除霸，割电线，破坏敌人交通线。游击小组在他和区干部的领导下捉拿汉奸12人。
1940年初，日寇又派一个大队（500余人）来东平设防，部署在东平、东阿、平阴，三县司令部设在东平城内。日寇挑拨国共关系，利诱国民党军，一起杀害共产党员和革命群众，形成敌、伪、顽三方对我夹击的尖锐复杂的斗争局面。1940年春，驻扎在东平县城的日军司令部委派汉奸焦元绅为伪三区区长兼区中队长（区部和区中队都设在须城镇）。他任职后，立即在全区建立伪乡、村政权。李耀珍抓住这个有利时机，把共产党员和进步人士打进去，当“白皮红心”的伪乡、村长。李耀珍和其他同志一起，经过两三个月的工作，先后在辛庄、后屯、石马、三旺、驻驾村、丁坞等7乡，须城、尚庄、大羊3镇，40多个村建立了抗日政权。除辛庄乡、须城镇外，有4个乡镇长是共产党员，3个乡镇长是进步人士。在此基础上，指导帮助有党组织的村成立农会、妇救会、青抗先、儿童团等抗日群众组织，动员各阶层“有人的出人，有钱的出钱，有力的出力”，组织农会会员、青年参军参战。在这期间，三区先后向军分区、县大队基干团选送400余人。同时，建立了50多人的抗日区队，除须城镇和辛庄乡外，普遍建立了乡、村自卫队。1940年下半年，三区和全县一样抗日斗争形势转入低潮，党组织由公开转入地下隐蔽活动。李耀珍带领区中队经常昼伏夜出，反奸除霸，破坏敌人交通线，袭击日伪据点，保护、掩护抗日干部过境，到肥城为八路军购买药品、衣被等军需物质，配合县大队开展武装斗争。他精心培、训练了一批可靠的地下联络员，为党组织传送情报，他们实行单线联系，暗号接头，严格保密。南至宿城、范村、后屯、北至大羊，西至金山口村，形成了秘密有效地下交通网络，为三区乃至全县的抗日工作做出了突出贡献。
1940年5月，正值青黄不接的时节。李耀珍根据县委指示，深入发动群众，以村为单位，向地主借粮，实行减租减息。当时，三区连年欠收，地主屯积粮食，而贫苦农民缺粮少米，吃糠咽菜。借粮可解决燃眉之急。所以，一经动员，很快形成高潮。三区当时是县委抓的点，全区100多个村，除敌伪据点（须城）附近及少数偏僻小村外，都轰轰烈烈的开展起借粮运动。驻驾村和尚庄除以村为单位进行借粮外，还联合5000多农会会员，向尚庄大地主尹祚墀进行借粮斗争。尹祚墀开始说给几十布袋（一布袋140斤左右），后又答应100布袋。以模范班、青抗先为骨干，从尹祚墀的地下仓中抄出600多布袋粮食（玉米、豆子、谷子、高梁、麦子）。石马乡组织5000多人向东豆山姓赵的大地主借粮。丁坞乡和三旺乡联合起来向北遂城的地主进行借粮。全区参加“红五月”借粮斗争的有3万人次。经过借粮和“双减”运动，贫苦农民借到了粮，渡过了春荒，家家户户喜气洋洋，抗日热情高涨，认识到共产党真心实意为老百姓着想，纷纷参加抗日群众组织，主动交纳粮食、柴草，支援抗日队伍。三区的借粮斗争，在李耀珍的积极工作下呈现生机勃勃的新气象，教育了群众，锻炼了群众，巩固了抗日组织和根据地，对东平北部山区震动很大。
