范筑先殉国后，鲁西北形势急剧变化。原范筑先组织的抗日武装成分复杂，在群龙无首的情况下，迅速分解;所建的各县抗日民主政府能坚持下来的也很少，1938年10月至1939年2月，日军出动了三万多兵力对冀南地区进行“扫荡”，大部分县城又一次被日军占领。1939年2月，日军“扫荡”之后，馆陶县长韩树义逃跑，敌人严密封锁卫河，筑先纵队(在冠县一带)与河西的联系更加困难。在这种形势下，筑先纵队报请鲁西区党委同意，于1939年5月成立了筑先纵队卫西三县军事指挥部，以指挥临西、馆陶、邱县三县的军事斗争，委任原第十一支队司令员牛连文为总指挥兼馆陶县县长，馆陶县政府从此由共产党领导。由于战事频繁，当时县政府的工作主要是领导人民进行反击日伪的武装斗争。
1939年9月，以牛连文为首的抗日民主政府和八路军一二九师先遣纵队紧密配合，除掉了企图投敌的保安大队大队长张星五，为馆陶、冠县人民除去一大害，也为抗日武装除去一大隐患。
1939年底，县长牛连文在六区区委驻地韩范庄召开县、区、乡、村四级干部会议，动员消灭国民党顽固派石友三设在馆陶县的招兵处。1940年1月，牛连文率筑先纵队独立团编入中央纵队警卫团，参加讨伐石友三的战役，独立团英勇作战，给石友三以沉重打击。
为了在抗日战争时期妥善的解决农民问题，中国共产党调整政策，由直接没收地主阶级的土地调整为减租减息。1939 年冬，县长牛连文在六区高庄召开关于推行减租减息动员大会，号召地主阶级要以民族大义为重，积极执行党的这一政策。第二年，抗日民主政府又颁布法令，推行合理负担。减租减息和合理负担的政策，适当调整了农村的生产关系，人民生活有了相当的改善，因而大大提高了广大人民群众的抗战积极性。
1940年秋，馆陶县人民在县委、县政府的领导下，掀起了轰轰烈烈的打狗、拆楼、挖沟、破路运动，切断了敌人的交通线，打乱了敌人的“扫荡”计划，为平原游击战的开展创造了条件。
1942年到1943年是馆陶县抗日战争最困难的时期。县委和县政府根据上级党的指示，在根据地建设方面先后施行了各项政策，为了团结各阶层人民坚持抗日，战胜困难，在政权建设上实行了“三三制”(共产党员、进步分子和中间分子各占三分之一)政策，较有社会影响的沈兰斋、郝国藩先后出任抗日民主政府县长。
1943年春，在县委、县政府的领导下，馆陶县根据地内开展了轰轰烈烈的借粮运动。是年秋天，馆陶县又发生了严重的蝗灾和洪涝灾害，在党的领导下，馆陶县人民以顽强的战斗精神，战胜了自然灾害，度过了灾荒。
在敌工工作方面，县抗日民主政府组织公安局与武工队铲除了少数危害较大的汉奸、特务和叛徒，分化瓦解了敌人，保卫了根据地的安全，有力配合了正面的武装斗争。
馆陶县抗日民主政府的成立，为馆陶县的抗日战争注入了强大的动力，从此，馆陶人民在共产党的领导下，顽强不屈，英勇战斗，最终取得了抗日战争的伟大胜利。
