山东文登人。1940年参加革命,中共党员。曾任山东省文登县大河区迎水乡农会主任,山东省东海地委文西县农会主任,山东省莱西县谭格区区委书记、宣传部长,平南县民运部部长,解放军南下中队指导员。全国解放后,历任江苏省金坛县委民运部长、县委副书记,上海化工厂党委书记。1955年1月,孙文卿任上海炼油厂党委书记。根据中共上海市委关于健全党委制的指示,孙文卿主持制定了加强党委集体领导的制度,规定凡企业的重大决策,均由党委集体讨论决定。在党委领导下,全厂职工开展劳动竞赛,大搞技术革新,对老装置进行挖潜改造,使生产有了较大发展。1956年4月,孙文卿和厂长江云海写信给中共中央主席毛泽东,汇报上海炼油厂的生产发展情况。是年,上海炼油厂提前17个月完成国家第一个五年计划规定的指标。1958年4月起,孙文卿先后任上海电缆厂党委书记、国营第二〇二五厂党委书记。1982年5月离休。